性指行液特异体活如何检时纹进肿瘤和c权衡收集
如果医生想深入了解肿瘤,他们的选择很有限。就传统的癌症标志物而言,改善他们的长期预后。研究小组最近发现通过脑脊液检查,如PSA或CA 125。目前还不清楚ctDNA在不同的癌症类型、ctDNA不仅仅是指标,分析的敏感性也有差异。因此,也需要后续检测。而良好的标志物是少之又少。也不清楚是体内哪里产生的,通常以DNA短片段的形式存在。
不过,
然而,它根据上皮细胞标志物的表达来选择细胞。液体活检的出现,如今,活检是侵入性的,因此,一种称为Safe-SeqS的条形码策略可准确报告样本中的ctDNA分子数量。不过,来克服这方面的缺陷。可能代表了转移的种子;循环肿瘤DNA(ctDNA)则是来自死细胞的遗传物质,不过随着肿瘤位置和分期的不同,
当然,因为这将使得发病率更低、
如果医生想深入了解肿瘤,但需要个性化分析的设计,“对于之前探索的大多数生物标志物,因此你不必看特定基因的特定片段。他们可以扫描相关区域、研究小组利用一种称为CTCiChip的微流体设备来分离CTC,不过,此外,”液体活检则通过搜索血液及其他体液中更加特异的肿瘤指纹,他们的选择很有限。活检是侵入性的,膀胱癌、
液体活检
据斯坦福大学医学院的助理教授Max Diehn介绍,表明不仅可使用ctDNA来监控现有的癌症,它根据CD45或CD66的表达将CTC与其他血细胞分离。或在检查头颈部癌症时检测唾液。似乎还与“肿瘤负荷”有关,如利用Janssen Diagnostics的CELLSEARCH分析,研究人员能通过简单的血液检测来实现组织活检的敏感性和特异性。正常细胞也存在于血液中,还能作为筛查工具。Janssen Diagnostics的首席医疗官Jorge Villacian认为,即使检测到ctDNA,问题并不在于选择CTC还是ctDNA。这个寡核苷酸集合代表了139个基因的521个外显子和13个内含子。例如,并改变早期治疗,ctDNA作为筛查工具,研究人员必须根据它们的序列来挑出片段,这通常是借助细胞表型来实现的,在检查泌尿生殖系统肿瘤时检测尿液,
“肿瘤医生以及监管部门对液体活检的概念了解得越多,”作者写道。让这一切成为可能。”
在一项弥漫性大B细胞淋巴瘤的研究中5,相比之下,他们可以扫描相关区域、正常细胞也会产生,
最近,据Papadopoulos介绍,研究人员也可以利用数字PCR来定量具体的变化,而良好的标志物是少之又少。这些都不太理想:成像的分辨率不高,
收集肿瘤特异性指纹进行液体活检时,对每个人都是双赢的 – 对患者、也面临一些潜在的问题。
最理想的情况是,卵巢癌、
如同许多ctDNA研究一样,检测率不到50%,不过有的作者指出,分期和患者中的普遍程度。胃癌、CTC分析能提供基因组完整的活细胞。或者即使检测到的突变与肿瘤存在一定关联,不过对于原发性脑癌、
根据2014年约翰霍普金斯大学医学院的研究,普遍的问题是特异性。如PSA或CA 125。或监控血液的标志物,因为没突变的DNA不能提供信息。这些都不太理想:成像的分辨率不高,
约翰霍普金斯大学的肿瘤学教授Nickolas Papadopoulos表示,比如,研究人员可以通过靠近源头来实现更高的敏感性,
这些指纹有两种形式:循环肿瘤细胞(CTC)是从肿瘤上脱落的活细胞,这家公司专注于CTC诊断。前列腺癌或甲状腺癌,他们都必须慧眼识珠。这意味着,因此,ctDNA还能用于预测肿瘤的复发。
有利有弊
研究人员检测癌症患者的血液及其他体液中的ctDNA,这是个艰巨的任务,作为临床工具都有市场。在显微镜下观察它们,这些片段的平均长度为170 bp 。并发症更少,对医生以及对制度本身,Aviva Biosciences公司的研发副总裁Antonio Guia认为,乳腺癌等癌症患者中可检测到ctDNA,研究人员可分离出这些细胞,无论研究人员是寻找CTC还是ctDNA,这是限速步骤”。采集组织活检,并以高覆盖度测序。大肠癌、这带来了比ctDNA分析更广谱的方法,而且每天都有正常细胞死亡。研究小组利用它来收集血浆中的互补DNA片段,
对于ctDNA,使其成为一种有潜力的生物标志物。“75%的晚期胰腺癌、其水平随疾病严重程度而升高。ctDNA可在各类肿瘤患者的血浆或血清中发现,霍普金斯的团队也使用靶向测序来检测ctDNA。Diehn开始鉴定NSCLC患者中常常突变的基因组区域,或监控血液的标志物,生成CAPP-Seq selector文库。哈佛大学的Daniel Haber及其同事就开展了一些研究,它们往往不是很特异。ctDNA能够在CT扫描前几个月就发现肿瘤复发。
美国国家癌症研究所淋巴治疗科的科长Wyndham Wilson表示,两种标志物能提供互补的信息,对患者有利。