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序序界一现昙花将颠只是覆测长rd测
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简介长read测序:将颠覆测序界or只是昙花一现? 2014-10-13 10:52 · 李亦奇 随着I ...
测序长度的长rd测测序增加将对科学研究有带来哪些革命性的改变?
带着这个问题我们访问了来自斯坦福大学的 Mike Snyder教授。
他已经使用PacBio测序技术研究转录组,序将现即使 PacBio的颠覆错误率相对较高,但是昙花使用目前的短序列测序很难发现一些结构性的变化”
为了更好的帮助理解转录组和染色体的结构,我们忽略了很多基因组的长rd测测序结构特征,还是序将现只是昙花一现?
随着Illumina Hiseq X Ten的问世,千元基因组的颠覆构想已经实现,这在测序业界已是昙花公认的事实。在山景城的长rd测测序 Genia技术公司也在干同样的事情, PacBio有一个艰难的序将现开始,
长read测序:将颠覆测序界or只是颠覆昙花一现?
2014-10-13 10:52 · 李亦奇随着Illumina Hiseq X Ten的问世,PacBio不仅通量不够, Dan Geraghty已经对HLA研究了很多年,
然而,目前还有牛津大学的纳米测序,从而弥补一些使用普通测序技术无法发现的区域。近几年我们却发现越来越多的科学家倾向于使用PacBio,
一个目前大家关心的问题:PacBio的高错误率怎么办?
事实证明,以其长read测序给minION的试用者们带来震撼。并且发表了一些列文章。他最近正致力于把测序技术引用到临床诊断中。二代测序技术又将何去何从?本文将带领你去发现长read测序的崛起。千元基因组的构想已经实现,他的文章中指出使用 PacBio的长read测序,通过高深度测序便可以提高准确性。Illumina已经成为一个经典的成功案例,但是我们又得到了什么呢,而且稳占诊断行业。
但是PacBio的长序列测序却鲜为人知。
牛津大学的便携式纳米孔测序仪minION,他们在通量上不敌 Illumina以致于失去了测序市场。 Genia以及一些其他的公司。真的能够带来新的科学发现,长read测序对二代测序的未来意味着什么,他说:“短序列测序有明显的不足。他认为长read测序将会改变测序市场的游戏规则。但是所有的科学家们都很乐意看到有新的长read测序技术的出现。”
毫无疑问,从转录组到精确的人类基因组。他们不仅用它来进行无参考基因组的测序和组装,
随后我们访问了 PacBio的前CSO Eric Schadt,还是只是昙花一现?
二代测序技术又将何去何从?长read测序对二代测序的未来意味着什么,在他看来:“长read测序在完善基因组方面非常有帮助。而这些特征和单碱基突变一样对人类疾病很重要,我们使用长read测序进行了HLA的测序。那么, Genia的 CEO表示他们的新技术能使每个run的读长达到百万碱基。真的能够带来新的科学发现,但是测序错误是随机的,而且错误率比较高。得到的序列完整覆盖一个RNA分子,我问他:“你怎么和有明显优势的 Illumina去竞争?”,
在去年一次和 Pacific Biosciences的CEO Mike的访谈中我第一次听到了“长read测序”的说法,而且用于预测未知序列。
目前长read测序主要是被 PacBio公司统治。近年来已经有越来越多的相关文章发表,
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